הסרה כירורגית של נגעי עור מבוצעת בתנאים סטריליים ותחת הרדמה מקומית. בצורה זו ניתן לשלוח את הממצא לבדיקה פתולוגית ולקבלת אבחנה מדויקת לגביו. ההסרה מומלצת לכל הנגעים התת עוריים ולנגעים הבולטים החשודים כממאירים (סרטן עור). כמו כן, מומלץ לכרות את כל השומות אשר בהן יש שינויים חשודים.
הסרת נגעי העור מתבצעת לכל שכבות העור, ולאחריה תופרים את החתך. את התפרים מוציאים אותם מוציאים תוך שבוע עד שבועיים. במידה ולאחר הכריתה הכירורגית נותר עור חסר, ייתכן ויהיה צורך בהעברת עור ממקום אחר באמצעות השתלת עור.